发酵床存在一些缺点，主要包括：
1、 产生异味：如果发酵床不得当，可能会导致发酵不完全或过度，从而产生有害物质和恶臭，这不仅会影响周围环境的空气质量，还可能对人体健康造成一定的危害。
2、 吸引害虫：发酵床中的有机物质可能吸引害虫，如蚂蚁、蝇类、蚊子等，这不仅对人体环境造成影响，还可能对庄稼和植物造成危害。
3、 容易传染病菌：有机物质的分解过程中，可能会产生一些病菌和有害微生物。如果发酵床管理不当，这些微生物也可能滋生在发酵床内部，造成疾病和卫生问题。
4、 使用量受限：发酵床所能处理的有机物质量比较有限，所以在大规模处理有机废弃物的场合，发酵床可能不是最理想的选择。
5、 需要一定的技术和管理：发酵床需要一定的技术和管理，如温度控制、湿度调节、垫料通透性管理、疏粪管理等，否则可能导致发酵床效果不佳或产生问题。
在选择是否使用发酵床时，需要综合考虑其优缺点，并根据实际情况进行决策。在使用发酵床时，需要加强管理，确保发酵床的正常运行和卫生安全。