生物菌肥是一种由多种有益细菌组成的有机肥料，可促进植物生长和提高土壤肥力。主要的菌种有以下几类：
1. 固氮菌：能够将空气中的氮气转化为植物可利用的氨态氮，提供给植物进行生长发育。主要包括糖尿菌、根瘤菌、自由生活的氮固氮菌等。其中，根瘤菌是广泛应用的一种固氮菌，它能够与豆科植物的根部共生，形成根瘤，使植物获得足够的氮素供应。
2. 磷解菌：能够分解土壤中的有机磷，将其转化为植物可吸收的无机磷，提高土壤的磷素含量，促进植物生长发育。主要包括放线菌、假单胞菌、芽孢杆菌等。其中，芽孢杆菌是常用的一种磷解菌，能够在不同的土壤环境中生长繁殖，对多种作物种类均有良好的促进作用。
3. 有机酸菌：能够分泌有机酸，降低土壤的pH值，提高土壤的酸解度和养分利用率，促进植物吸收养分。主要包括酸乳杆菌、乳酸杆菌、酵母菌等。其中，酸乳杆菌是广泛应用的一种有机酸菌，能够降低土壤的pH值，促进磷、锌、钙等元素的矿化和植物吸收。
4. 硝化菌：能够将土壤中的氨态氮转化为硝态氮，提高土壤的氮素含量，促进植物生长发育。主要包括氨氧化菌和硝化菌。其中，氨氧化菌是硝化菌中的一类，能够将氨态氮转化为亚硝酸和硝酸，提供给植物进行吸收利用。
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