华硕B660主板的两个M.2接口在设计和功能上有一些区别。
这两个M.2接口的位置不同，一个位于CPU和显卡之间，另一个位于显卡下方。通常，位于显卡下方的M.2接口可以提供全速的传输性能，而位于CPU和显卡之间的接口可能只能提供半速的传输性能。这也可能因主板的具体设计和配置而有所不同，所以最好参考主板的标识或说明书来确定每个接口的具体性能。
这两个M.2接口所支持的通信协议也可能不同。一些主板的M.2接口可能只支持PCIe协议，而另一些可能还支持SATA等其他协议。即使两个接口都支持相同的通信协议，它们的传输速度也可能有所不同。例如，其中一个接口可能支持PCIe 4、0，而另一个只支持PCIe 3、0。
这两个M.2接口在散热设计上也可能有所不同。一些主板的M.2接口可能配备了散热装甲，以提高固态硬盘的散热性能，从而保持稳定的传输速度。
华硕B660主板的两个M.2接口在位置、支持的通信协议、传输速度和散热设计等方面可能存在差异。在选择和使用固态硬盘时，需要根据具体的需求和主板的规格来选择合适的接口。