1. 微生物参与生物圈物质循环：微生物在分解有机物、氮、磷等元素中起到重要作用，促进了生物圈的物质循环。例如，土壤中的细菌和真菌可以分解落叶、枯枝等有机物并将其转化为养分，供植物吸收利用。某些细菌能固定氮，将氮气转化为可利用的化合物，为生物提供了重要的营养物质。
2. 微生物与生物圈相互影响：微生物不仅能受到生物圈中其他生物的影响，也可以对生物圈产生影响。例如，某些细菌和真菌是植物的共生菌，它们与植物根系形成联合体，为植物提供养分，同时也得到了生存所需的养分和空间。
3. 微生物与环境污染：微生物也参与了环境污染的产生和处理。例如，某些细菌能降解有机污染物，对于环境的修复有一定作用。但在一些情况下，微生物也可能成为污染源，如在厌氧环境下产生的甲烷等温室气体，会对环境和气候造成负面影响。
4. 微生物与生物多样性：微生物是生物圈中最为丰富和多样的生物之一，它们的多样性和数量直接影响着生物圈的稳定性和健康。微生物也受到生物圈变化的影响，生物圈的变化可能导致微生物群落的改变，进而影响到整个生态系统的平衡。