1. 大部分深海鱼类：由于深海环境极端恶劣，深海鱼类生命周期长，繁殖率低，且需要大量的渔业资源和技术支持，所以人工养殖极其困难。
2. 珍稀野生贝类：如巨型扇贝、珍珠母贝、黑蚝等，一些贝类的自然繁殖环境和生长条件都非常苛刻，人工养殖的难度及成本极高。
3. 海星：目前尚未成功人工繁殖过海星。
4. 毒鱼类：如河豚、带鱼等，含有剧毒成分，人工养殖需要极其严格的环境控制和技术要求，目前难以实现商业化生产。
5. 稀有海藻：如海带、紫菜、裙带菜等，在特定的生长环境下生长周期长、繁殖力低，人工养殖难度相对较高。