农田灌溉水有效利用系数的计算方法是:有效利用系数=实际灌溉量/灌溉总量。其中,实际灌溉量是指灌溉水在农田中被作物吸收利用的部分,灌溉总量是指灌溉水总量减去流失、蒸发等损失的部分。
例如,如果一块农田总共灌溉了1000立方米的水,在作物吸收利用了800立方米后,有200立方米的水被浪费流失了,那么这块农田的有效利用系数就是0.8。