大黄花鱼和小黄花鱼在外观、生态环境、食性等方面都有很大的差异。大黄花鱼生长快、个头大、游荡范围广,喜欢生活在岩石海底或珊瑚礁附近的深海海域,食性广泛,喜欢吃小鱼、烤虾等。而小黄花鱼体型小、颜色鲜艳、生长速度慢,生活在浅海水域,喜欢游弋在海草丛、岩石间等区域,以小型甲壳类为食。