《巨齿鲨2》原著小说是：《深海侏罗纪》（Meg:ANovelofDeepTerror）。
《巨齿鲨》系列电影是改编自史提夫艾尔顿（Steve Alten）的〈MEG〉系列小说，第一集《巨齿鲨》是改编自1997年小说〈Meg:A Novel of Deep Terror〉，此书在当年出版时，可说是一部灾难惊悚类的小说界翘楚，不仅成为年度畅销小说，更是引起广大的热议与讨论，作者之后又陆陆续续推出许多续作，包含1999年〈The Trench:Meg 2〉（这本改编成《巨齿鲨2：海沟深渊》）、2004年〈Meg:Primal Waters〉、2009年〈Meg:Hell’s Aquarium〉、2011年前传作品〈Meg:Origins〉、2016年〈Meg:Nightstalkers〉、2018年〈Meg:Generations〉，第八部续作〈Meg:Purgatory〉则预计在2024年出版。
《深海侏罗纪》原著中作者意有所指的将霸王龙写成T-Rex，挑衅意味十分浓厚。他聪明地避开千篇一律的恐龙题材，选择真实感更强的巨齿鲨倖存论，更为巨齿鲨创造Meg这个好记的非正式缩写，展现打造新电影怪兽的雄心。对急于推销作品的艾尔顿来说，比起伤害脆弱的人类，与霸王龙一较高下更能突显巨齿鲨的商业优势：一只巨大、敏捷有力，且凶猛嗜杀的古老掠食者。
不过无论是作者本人，或他笔下的古生物学教授琼纳斯泰勒（JonasTaylor）都忘了一件事：恐龙时代的确有鲨鱼，但巨齿鲨是恐龙灭绝后才出现的品种。就一本标榜真实恐惧的小说而言，著实有些尴尬。或许这是取材上的疏漏，但更有可能是为了增加卖点而刻意为之。有趣的是，艾尔顿在2005年发行的修订版里默默删去不少错误的科学知识，却保留了这场龙鲨大战的细节，可见其重要性。