汪淼和叶文洁是亦师亦友的关系
汪淼和史强算是这部剧很重要的两个角色，汪淼是纳米材料专家，也是环保主义者，后来加入了科学边界，史强是警察，与汪淼是好友。汪淼跟天体物理学家叶文洁亦师亦友，两人关系很好。
叶文洁和红卫兵叶文雪是姐妹，红岸基地总工程师杨卫宁和雷志成是同事，杨卫宁和叶文洁是夫妻，叶文洁将杨卫宁误杀，理论物理学家杨冬是他们的女儿。
伊文斯是天体物理学家和降临派创始人，也是地球三体组织创始人，他跟叶文洁是同志，但两人互不信任。生物学家潘寒是叶文洁的下属，他枪杀了日籍华裔物理学家申玉菲，三体问题研究者魏成和申玉菲是夫妻。
大学理论物理教授叶哲泰是叶文雪的父亲，理论物理学家杨冬和丁仪是情侣，而汪淼跟丁仪是朋友。史晓明是天体物理学家，也是史强的父亲。特种作战专家斯坦顿、陆军少将常伟思和计算机专家徐冰冰都是史强的下属，海军舰队政委章北海是常伟思的下属。
罗辑和庄颜是夫妻，白蓉是罗辑的前女友，看来罗辑的感情线比较丰富，罗辑和程心是新老持剑人，程心和维德争夺持剑人，两人关系不好。程心的感情线复杂，她和关一帆是恋人关系，但是云天明跟她也很暧昧。
